在Linux系统中，脚本文件的存放位置取决于其用途和类型。以下是几个常见的脚本存放位置：

系统级脚本：这些脚本通常与系统管理、初始化、配置或权限认证相关。

/usr/bin：主要存放所有用户都可用的系统程序，即普通的基本命令。
/etc：存放系统管理程序和脚本，包括权限认证、设置及用户管理脚本等。例如，系统启动与关闭时，会调用/etc/init.d或/etc/rc.d目录下的执行性脚本，从而实现对系统的控制。
/etc/rc.d：Red Hat系列发行版使用的目录，用于存放启动脚本。
/etc/init.d：Debian系列发行版使用的目录，用于存放启动脚本。
用户级脚本：这些脚本可能是某个特定用户创建的，或者用于特定应用程序。

用户的家目录：某些脚本可能会存放在用户自己的家目录下，例如.bashrc等配置文件。
/usr/local/xxx/bin：对于某些特定软件（如Mysql或Apache），它们的脚本可能存放在软件的安装目录中，例如/usr/local/mysql/bin或/usr/local/apache2/bin。
临时脚本：一些临时或一次性的脚本可能会存放在/tmp目录下。

另外，当执行脚本时，脚本的工作目录（即执行时所在的目录）和脚本的存放路径是两个不同的概念。工作目录可以通过在脚本中使用pwd命令来获取，而脚本的存放路径可以通过dirname $0来获取。在脚本中，可以使用cd命令来改变工作目录。

总的来说，Linux中脚本的存放位置是多种多样的，取决于其用途、类型以及管理员或用户的个人习惯。在选择存放位置时，应考虑到脚本的访问权限、执行环境以及与其他文件的关联等因素。