1.逻辑结构

MongoDB 与 MySQL 中的架构相差不多，底层都使用了可插拔的存储引擎以满足用户的不同需要。用户可以根据程序的数据特征选择不同的存储引擎，在最新版本的 MongoDB 中使用了 WiredTiger 作为默认的存储引擎，WiredTiger 提供了不同粒度的并发控制和压缩机制，能够为不同种类的应用提供了最好的性能和存储率。
在存储引擎上层的就是 MongoDB 的数据模型和查询语言了，由于 MongoDB 对数据的存储与 RDBMS有较大的差异，所以它创建了一套不同的数据模型和查询语言。

2.数据模型

2.1内嵌

内嵌的方式指的是把相关联的数据保存在同一个文档结构之中。MongoDB的文档结构允许一个字段或者一个数组内的值作为一个嵌套的文档。

主要适用于:

1. 数据对象之间有包含关系 ,一般是数据对象之间有一对多或者一对一的关系 。
2. 需要经常一起读取的数据。
3. 有 map-reduce/aggregation 需求的数据放在一起，这些操作都只能操作单个 collection。

2.2引用

引用方式通过存储数据引用信息来实现两个不同文档之间的关联,应用程序可以通过解析这些数据引用来访问相关数据。

主要适用于:

1. 当内嵌数据会导致很多数据的重复，并且读性能的优势又不足于覆盖数据重复的弊端 。
2. 需要表达比较复杂的多对多关系的时候 。
3. 大型层次结果数据集嵌套不要太深。

3.存储引擎

3.1 概述

存储引擎是MongoDB的核心组件，负责管理数据如何存储在硬盘和内存上。MongoDB支持的存储引擎有MMAPv1 ,WiredTiger和InMemory。
InMemory存储引擎用于将数据只存储在内存中，只将少量的元数据(meta-data)和诊断日志（Diagnostic）存储到硬盘文件中，由于不需要Disk的IO操作，就能获取所需的数据，InMemory存储引擎大幅度降低了数据查询的延迟（Latency）。
从MongoDB3.2开始默认的存储引擎是WiredTiger，3.2版本之前的默认存储引擎是MMAPv1. MongoDB4.x版本不再支持MMAPv1存储引擎。

3.2 WiredTiger存储引擎优势

1. 文档空间分配方式
   WiredTiger使用的是BTree存储;
   MMAPv1使用的是线性存储;
2. 并发级别
   WiredTiger使用文档级别锁;
   MMAPv1使用表级锁;
3. 数据压缩
   WiredTiger采用snappy (默认) 和 zlib 压缩表数据;
   WiredTiger相比MMAPV1(无压缩) 空间节省数倍;
4. 内存使用
   WiredTiger 可以指定内存的使用大小;
5. Cache使用
   WiredTiger引擎使用了二阶缓存WiredTiger Cache, File System Cache来保证Disk上的数据的最终一致性;
   MMAPv1 只有journal 日志;